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CueMol: Molecular Visualization Framework
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CueMol2
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チュートリアル
CueMol2 GUIのチュートリアル
CueMol2を使用して論文用の図を作ろう
CueMol2 GUIのチュートリアル動画1@togotv
CueMol2 GUIのチュートリアル動画2@togotv
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マニュアルなど
Renderer groupについて
Object, Rendererなどのコピー・ペースト
Scene保存時のオプション
Styleについて
Cameraについて
Camera情報を外部ファイルに保存しシーン間で共有
Cameraにrenderer等の表示・非表示状態を保存する
色の指定方法
分子
英語版: CPK renderer
英語版: Ballstick renderer
Disordered領域の表示 (disorder renderer)
タンパク質のRibbon表示
タンパク質のCartoon表示
Nucleic acidの表示 (nucl renderer)
Tube表示 (tube renderer)
二次構造の割り当て
分子の重ね合わせ
矩形による原子の選択
選択文法のマニュアル
新たな共有結合をつくる
相互作用の自動抽出
分子に対する着色
POV-Rayによるレンダリング
POV-Ray rendering dialogについて
半透明の物体のレンダリング
Materialについて
エッジ線描画とアニメ調レンダリング(Toon rendering)
Radiosity法を使用した奥行き感のあるレンダリング
光源の設定について
その他形式のレンダリング・Export・Import
PNG画像ファイル等への直接書出し
POVファイルへの直接書出し
外部ソフトWarabiによるアニメ調レンダリング(Toon rendering)
その他3Dソフトウェア/CAD形式への書出し
PyMOL session fileの読み込み
分子表面(溶媒接触表面)
分子表面の作成
分子表面の表示
分子表面の断面生成
Electrostatic potential map
APBSとPDB2PQRのインストール
APBSによる静電ポテンシャルマップの計算
電子密度マップ・ボリュームデータ
電子密度マップ・ボリュームデータのメッシュ表示
電子密度マップ・ボリュームデータの面表示
GPUを利用した電子密度マップの表示
アニメーション
基本と単純スピン
複数アニメーションの組み合わせ・Quadric値
カメラの移動
表示・非表示の変化
分子のmorphing
POV-Rayレンダリングと動画ファイルの作成
環境設定その他
OpenGL shaderの無効化
Stereo glassとhardware stereo (Windowsのみ)
Software updateの告知
UIの言語
Multi-touch trackpad (MacOS Xのみ)
分子ビューのmouse操作設定
Crash時のメモリーイメージダンプ
ActiveX control, mobile device versionなど
ActiveXコントロール
Light-weight sceneについて
iOS版CueMol viewerについて
Build方法など
Scripting interface
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その他
NVIDIA 3D vision用ケーブルの自作
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CueMol1
CueMol1の方は配布とドキュメントの公開は続けておりますが, 現在開発を終了しており,バグフィクス等のサポートができない状態ですのでご了承ください.
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チュートリアル
CueMol1.1 GUIのチュートリアル
CueMol1.1 QScriptのチュートリアル
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その他マニュアルなど
HowTo/その他の雑多なメモ
非標準(天然アミノ酸・AT/UGC以外の核酸)残基のトポロジーの扱い方.
分子表面(molsurf)レンダラーの複雑な着色.
分子表面(溶媒接触表面)の断面生成.
CueMolの出力したPOVRayファイルを編集して手の込んだ図を作る.
分子選択文法のリファレンス
ballstick, CPK等で複雑な着色をしたい場合
ファイルの関連付けについて
QScriptで外部ファイル入出力
ファイルOpen時のoption設定
Model buildingと編集機能
ActiveXコントロール
リファレンス マニュアル
QScript文法リファレンス
(未完成)
ソースからのビルド方法
メニュー
FrontPage
Gallery
Updates
不具合情報とか
動作環境
Download
Install
Documents
Development
Licence
寄付
メーリングリスト
リンク
SourceForge
最新の10件
2022-03-16
Download
FrontPage
cuemol2/SelSyntax
cuemol2/DensityMapSurf
cuemol2/MultiGradColoring
cuemol2/APBS_Install
Licence
2015-12-27
cuemol2/Scripting/Property
cuemol2/Scripting
cuemol2/Scripting/Renderer
Last-modified: Sat, 26 Dec 2015 22:37:20 JST (3214d)